江西省是我国中药材主要产区之一，省医药部门收购使用的中药有342种，而九连山保护区内分布的有267种，占78%。
　　（2）山林野菜　江西已知可食的森林山野蔬菜约300种，这些山林野菜越来越受到人们的青睐。九连山自然保护区已知可食的野菜有154种，大多数种类是药食两用，如鸡丛Collybia albuminosa，竹荪Dictyophora indusiata 等，是极为名贵的山珍；沙参Adenophora tetraphylla、桔梗Platycodon grandiflorum、百合Lilium brownii、魔Amorphophallus riuieri 、山药Dioscorea opposita 等是极受欢迎的药食两用野菜。
　　（3）观赏植物　丰富多彩的野生植物是构成自然景观的主要成分，各种野生植物都有其独特的观赏价值。野生观赏植物是栽培观赏植物的祖先和未来新品种的源泉。本区价值较高的野生观赏植物有1700余种，按照其生物学特性、主要观赏部位、功能等，可以分为观叶植物、观花植物、观果植物、观赏蕨类植物植物、攀缘观赏植物、水生观赏植物、珍稀濒危观赏植物和药用观赏植物等8大类，这些野植物本身肯有极高的观赏价值，更是园林观赏植物育种的种质资源和原始材料。
　　（4）林木资源　九连山自然保护区内已查明的乔木和灌木树种有960种，约占全国乔灌木种类12%，其中许多是重要的用材树种，如壳斗科Fagaceae、樟科lauraceca、山茶科Ca-melliaceae、木兰科Magnoliaceae、杜英科Elaeocarpaceae、金缕梅科Hamamelidaceae、松科Pinaceae和杉科Taxodiaceae等的树种。樟科、木兰科的种类更是非常珍贵的树种。保护区的常绿阔叶林内还分布一定数量天然杉木，中国科学院李昌华研究员认为“在常绿阔叶林中混有这样多的天然杉木，而且生长的好，实不多见（李昌华　1987）。“江西龙南县的杉木（一向称为“龙木”）最为驰名”（吴征镒　1980）
　　2．2野生动物
　　2．2．1脊椎动物
　　九连山自然保护区已查明的脊椎动物有384种，占全省种类的45.1%，其鸟类、兽类、两栖类和爬行类的种类均占全省一半以上（表1-5）。九连山自然保护区分布的脊椎动物中，属国家重点保护的动物有46种，占全省46%；属江西省级重点保护的有68种，占全省种类58.1%；列入濒危野生动物种国际贸易公约名录有的50种，占全省种类51%。
　　　　　　　　表1-5江西九连山自然保护区野生动物统计表

　　（1）哺乳动物　九连山保护区已查明的哺乳动物有５７种，隶属７目１８科，占江西省哺乳动物种类的５４.3%。在我国动物地理区划上，本区属于东洋界华中区东部丘陵平原亚区的南部，与华南区相邻，具有热带一亚热带的特点。既有典型的热带种类，如斑林狸Prionodon pardicolor、也有热带一亚热带种，如大灵猫Viuerra zinetha、小灵猫Viuerric-ula indica 、赤鹿Muntiacus muntijak、水鹿Cervus unicolor等，还有我国南北广泛分布的种类，如赤狐Vulpes vulpes、水獭Lutra lutra、野猪Sus scrofa、豹猫Felis bengalensis等。
　　哺乳动物中属国家Ⅰ级重点保护动物有华南虎Panthera tigris、豹猫Felis nengalensis等。Neofelis nebulosa等3种；列入国家Ⅱ级重点保护动物有豺Cuon alpinus 、黄喉貂Martes flauigula、I水獭Lutra lutra、水鹿Cervus unicolor、獐Hydropotes inermis等11种；属于江西省级重点保护的有毛冠鹿Elaphodus cephalophus、黄麂Muntiacus reeuesi、赤鹿M.muntijak、赤狐Vulpes vulpes vulpes等12种。
位于赣粤边境的九连山，是华南虎的主要分布区之一。江西境内最后猎获的华南虎是1991年在九连山保护区毗邻的全南县（刘智勇　1999）。近年来国内外动物专家调查指出，包含九连山保护区在内的南岭地区仍然有华南虎。
　　（2）鸟类　九连山保护区已查明的鸟类有226种，隶属16目50科，占江西省鸟类种数53.8%。区系成分中东洋界98种占43.6%；古北界61种，占26.99%；广布种67种，占29.65%。
　　鸟类中属国家重点保护野生动物名录有30种，其中白颈长尾雉Syrmaticus ellioti 和黄腹角雉Tragopan caboti属国家Ⅰ级重点保护动物；属国家Ⅱ级重点保护动物有28种，如海南虎斑鳽Gorsachius magnificus、白鹇Lophura nycthemera、勺鸡Pucrasia macrolopha、仙八色鸫Pitta nympha等，猛禽种类较多，鸮类7种、膺隼类有14种。猛禽属于食物链的顶端物种，猛禽多，说明可借捕获的动物多。属江西省级重点保护动物有46种，如中华鹧鸪Francolinus pin-ysfrsnud 、灰胸竹鸡Bambusicola thoracica 、雉鸡Phasianus colchicus 、山斑鸠Streptl pelia orien-talis.大杜鹃Cuculus canorus、中杜鹃C.saturatus、小杜鹃C.poliocephalus等。
　　海南虎斑鳽、斑头大翠鸟Alcedo Hercules、黑眉拟琢木鸟Megalaima oorti、黑冠黄鹎Pycnonotus melanicterus、、烟腹毛脚燕Delichon dasypus、裼背翁鸟贝鸟Hemipus picatus和黑喉山鹪莺Prinia atrogularist等7种鸟是江西新记录。特别是海南虎斑鳽、，野外种群数量极少，2001年在九连山自然保护区发现其繁殖种群。
　　（3）两栖类　保护区内已查明的两栖动物21种，隶属2目7科，占江西省已知两栖动物种类53.85%，大多属于华中华南区系。属国家Ⅱ级重点保护动物有虎纺蛙Rana rugulo-sa，属江西省级保护动物有黑斑肥螈Pachytriton breuipe、棘胸蛙Paa spinosa 等。
　　（4）爬行动物　九连山保护区内已查明的爬行动物有44种，占江西省已知爬行动物种类的55.7%。隶属2目13科。区系成分华南区占36%，华中华南区占48%，华中区占8%。属国家Ⅰ级重点保护动物有蟒蛇Python molurus ,属省级重点保护区动物有灰鼠蛇Ptyas kor-ros、银环蛇Burganus multicinctus、尖吻蝮Deinagkistrodon acutus 等4种。海南闪鳞蛇Xe-nopeltis hainanensis、蟒蛇、白唇竹叶青Trimeresurus albolabris 、光蜥Ateuchosaurus chinen-sis、中国棱蜥Tropidophorus sinicus、丽棘蜥Acanthosaura lepidogastert 和眼斑龟Sacalia bealei是钟昌富在九连山发现的江西新记录。
　　（5）鱼类　保护区的鱼类已查明有36种：占江西省鱼类17.3%；隶属6目14科，其中属江西省级重点保护动物有褐栉鰕虎鱼Ctenogobins brunneus、斑鳢Ophiocephalus macu-lata和月鳢Channa asiatica.
　　2.2.2贝类和甲壳动物
　　经初步调查九连山保护区有贝类27种，其中淡水贝类8科18种，陆生贝类7科9种。放逸短蜷Semisulcospira libertina在九连山广泛分布。
　　2．2．3昆虫
　　九连山自然保护昆虫种类十分贫富，类型繁多。区系成分复杂，已查明的种类有19目202科987属1404种。占江西已知昆虫种类21.23%。约占全国已知昆虫种类的3.5%。昆虫区系共有24个分布类型，以东洋界成员为主体，占总数62.27%，这说明九连山自然保护区昆虫基本上属于东洋界范畴。在海拔60cm以下的阳坡及沟谷常见到热带区系成公的种类，如巴黎翠凤蝶Papilio paris、宽带凤蝶东部亚种P .nephelus chaonulus等。而赤曼蝽Menida histrio、橙粉蝶Ixias pyrene pyrene、白蚬蝶等更是典型的热带种类。其中橙粉蝶在九连山是分布区的北限。
　　按中国动物地区区划，九连山昆虫共有35个分布类型，是江西省各自然保护区昆虫区第关系最复杂之地，华中、华南、西南三区共有种占17.61%；华中、华南二区共有种占15.47%；华中特有种占总数11.74%。以上三个分布类型总计占44.82%。
　　九连山保护区昆虫中属国家重点保护动物的有硕步甲Carabus　dauidis、阳彩臂金龟Ciheirotonus　jansoni；属江西省级重点保护动物有金裳凤蝶Troides aeacus aeacus等。此外，比较珍贵的还有鹤顶粉蝶Ilebomoia　glaucippe 、宽尾凤蝶Agehana elwesi 、黎氏青凤蝶Graphium leechi等数十种。
　　九连山保护区植物区系丰富，植被多样，昆虫种类多。这些年不断有新种发现，中国科学院上海昆虫研究所何秀松在九连山发表了1个新属——棘慰属Pilotermes；2个新种——江西棘慰Pilotermes jiangxiensis和短鼻角慰Nasutitermes curtinasus。
　　在九连山自然保护区发现的新种还有长尾小卷蛾Sorolopha longurus、隆脊角胫象Shirahoshizo lineonus、江西钩冠角蝉Hypsolyrioum jiangxiensis、闪豆斑钩蛾Auzata ama-ryssa等11个新种和2个新亚种。而粗足角胫象Shirahoshizo pini属于中国新纪录。
　　2．3湿地生物
　　在九连山自然保护区的森林景观中，湿地是一些“小斑块”——一林间低洼沼泽和细长的“走廊”——溪间小河及河岸带。保护区水域总面积60hm2，，加上河岸等天然湿地面积只占总面积约1%，然而，这些湿地是动植物种类最丰富的地方。已查明湿地脊椎动物141种，占全区脊椎动物种数36.7%；除36种鱼类外，典型的水禽有49种，其中不少是森林湿地栖息鸟类，如褐河乌Cinclus pallasii、红尾水鸲Rhyacornis fuliginosus 等；哺乳动物中属湿地动物有12种，如水獭Lutra lutra、小灵猫Viuerricula 、食蟹獴Herpestes urua、鼬獾Melogale moschata 　狗獾Mele meles 、猪獾Arctonyx collaris、水鹿Cervus unicolor、獐Hydrophotes inermis等。此外，已查明淡水贝类有18种、虾蟹类水生甲壳动物3种。野生植物中属于湿地植物有405种，占全区高等植物种类14.7%。其中苔藓类56种，如溪苔Pellia epiphylla、钱苔Riccia glauca 。暖地泥炭藓Sphagnum junghunianum 、加萨泥炭藓S.khasianum、秃叶泥炭藓S.obtusiculum、泽藓Philontis nieida、东亚泽藓Ph.Tu-rneriana等；蕨类植物有13种，如节节草Hippochaete ramosissima、尖头瓶儿小草Ophio-glossum pedunculosum、蘋Marsilea quadrifolia、槐叶蘋Salvinia natans、满江红Azolla imbricata 等；被子植物有336种，主要是草本植物，其中双子叶植物174种，如小二仙草科Haloragaceae、柳叶菜科Onagraceae、裸果本科Illecebraceae、蓼科Polygonaceae 、虎耳草科Saxifragaceae、毛莨秒Ranunculaceae等；单子叶植物有162种，主要是莎草科Cyperace-ae、禾本科Poaceae、灯心草科Juncaceae、浮萍科Lemnaceae、泽泻科Alismataceae等。木本植物有江南桤木Alnus trabeculosa、银叶柳Salix chienii、长梗柳S.dunnii等。江南桤木在林中洼地形成小片纯林，而柳树大多沿溪涧岸边分布。